Athenen liittolaisten joukossa oli monia kreikkalaisen mytologian sankareita, mukaan lukien Odysseus Jason Perseus ja Herakles. Koska hän oli kreikkalaisten puolella Troijan sodassa, hänen vihollisiaan olivat Paris ja muut Troijan puolustajat. Hänen vastustajiensa joukossa olivat Hephaestus ja Poseidon.
Kreikkalaisen mytologian mukaan Athena auttoi Jasonia hankkimaan kultaisen fleecen. Hän auttoi myös Perseusta Medusan pään mestauksessa. Hän neuvoi Heraklesta käyttämään Nemean leijonan omia kynsiä leikkaamaan sen valloittamattoman nahan läpi, antoi hänelle helistimen pelästyttääkseen Stymphalian lintuja, jotta hän voisi tappaa ne ja auttoi häntä pääsemään alamaailmaan voittamaan Cerberuksen. Athena tarjosi Odysseukselle neuvoja koko Troijan sodan ajan, suojeli häntä hänen vaelluksissaan, ohjasi häntä kotiin ja auttoi häntä saamaan takaisin kotinsa ja vaimonsa.
Kreikkalainen myytti kertoo, että Aphrodite Hera ja Athena väittivät kaikki olevansa kaunein jumalatar ja Zeus nimitti Parisin troijalaiseksi prinssiksi päättämään heidän välillään. Pariisi valitsi Aphroditen Athenen sijaan, ja tämä sai Athenen suosimaan Kreikan puolta Troijan sodassa. Vaikka sekä Ares että Athena olivat sodan edustajia, hän symboloi viisautta ymmärrystä rohkeutta kunniaa ja moraalista ylivoimaa pelkoa ja verenhimoa. Vaikka Athena tunnustetaan neitsytjumalattareksi, hänestä tuli äiti. Hephaestus, Zeuksen ja Heran poika, yritti raiskata hänet, ja kun hänen siemenensä putosi hänen jaloistaan maahan, syntyi puolikäärme puoliksi mies Erichthonius. Poseidonista tuli Athenan vastustaja kiistan vuoksi siitä, kuka olisi Ateenan suojelija. Kilpailussaan he tarjosivat ateenalaisille lahjoja. Poseidon tarjosi ateenalaisille suolaisen veden suihkulähdettä, mutta Athena voitti tarjoamalla heille oliivipuun.
