Mark Harmon tienaa 525 000 dollaria plus voittoprosenttia johtavasta roolistaan NCIS:ssä. Pauley Perrette ja Michael Weatherly ansaitsevat 175 000 dollaria jaksoa kohden rooleistaan sarjassa.
Mark Harmonin sopimus päivitettiin nykyiseen tilaan, kun NCIS uusittiin 11. kaudeksi vuonna 2013. Harmonin palkka teki hänestä televisiossa parhaiten palkatun draamanäyttelijän allekirjoitushetkellä Ashton Kutcherin ja Jon Cryerin jälkeen roolistaan elokuvassa Two and a Half Men. Harmonista tuli parhaiten palkattu näyttelijä televisiossa vuonna 2015, kun Two and a Half Men päätti 12 kauden mittaisen jaksonsa. Näyttelijän palkkansa lisäksi Harmon saa jäljellä olevat maksut NCIS:n vastaavana tuottajana.